A Secretaria de Educação do Estado de Alagoas possui 17 escolas específicas, diferenciadas e interculturais, que oferecem educação de qualidade e respeitam as tradições e a diversidade cultural dos povos indígenas da região. Essas escolas atendem mais de três mil estudantes, pertencentes a nove dos doze povos indígenas de Alagoas, incluindo Jiripankó, Katokinn, Koiupanká, Aconã, Kariri-Xokó, Karapotó, Tingui-Botó, Xukuru-Kariri e Wassu-Cocal.
Todas as 17 escolas da rede estadual oferecem Educação Infantil e Ensino Fundamental, e sete delas também oferecem Ensino Médio. Em 2023, a Escola Estadual Indígena Pajé Francisco Queiroz Suíra, em Porto Real do Colégio, iniciou o Ensino Médio pela primeira vez. Além disso, a rede estadual implantou o ensino integral em uma escola indígena pela primeira vez, na Cacique Alfredo Celestino, na Serra da Capela, em Palmeira dos Índios.
Os quadros funcionais das escolas são compostos principalmente por indígenas, com alguns profissionais não indígenas. A matriz curricular segue a Base Nacional Comum Curricular (BNCC) e as Diretrizes Curriculares Nacionais da Educação Escolar Indígena. Seguindo as bases legais, a Educação Escolar Indígena em Alagoas é específica, diferenciada e intercultural devido aos processos pedagógicos de aprendizagem relacionados aos conhecimentos sistematizados e às culturas de cada povo, de cada comunidade, permitindo o respeito à diversidade cultural como uma proposta inclusiva na educação.
Em comemoração ao Dia dos Povos Indígenas, em 19 de abril, o Governo do Estado lançou o programa Pontapé Indígena. Desenvolvido pela Secretaria de Planejamento, Gestão e Patrimônio, o programa visa formar um banco de estágios não obrigatórios de nível superior para estudantes matriculados no Curso de Licenciatura Intercultural Indígena. Esses estudantes atuarão em escolas de suas comunidades relacionadas às suas etnias e precisarão apresentar uma carta de anuência assinada pelas lideranças das comunidades onde as escolas escolhidas estiverem localizadas para exercerem atividades relacionadas ao estágio.